从控制论的角度看，细胞内的基因转录调控本质上是染色质三维结构约束下的复杂系统控制问题，如何辨识关键调控靶点、解析调控规律是生物医学的重要基础性问题。申请人从复杂基因转录调控系统的精准观测、智能辨识和高效应用三个角度开展研究：①基于深度学习等技术实现了有限测序数据下的高维基因组精准观测；②研发了三维调控智能分析方法，实现了一种智能化、自动化的基因转录调控解析范式；③应用这些方法，预测并验证了特殊损伤和重要疾病相关的关键靶标。成果发表在Nat.Mach.Intell、JCI、NC、GR、GB等期刊，入选军事医学研究院十大标志性进展，获得多位美国科学院院士的正面评价，被央视、新华社报道。申请人入选全军青年科技英才、北京市科技新星，获得叶剑英英才奖。拟发展可解释的高维基因转录调控智能分析方法，揭示辐射诱导的基因变异与染色质结构的关系，挖掘辐射致癌机制，为人工智能加速生物医学发现开辟先进的技术路径。