DPImpute: A Genotype Imputation Framework for Ultra-Low Coverage Whole-Genome Sequencing and its Application in Genomic Selection
编号:7
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更新:2025-03-27 22:42:37
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口头报告
摘要
本研究开发了一种全新的超低覆盖度全基因组测序(ulcWGS)基因型填充计算框架DPImpute,在基因组育种共性技术领域取得了重要创新性突破,其创新性体现在:采用两阶段填充策略,显著提升低覆盖度(≤0.1X)下的基因型一致性,且支持小参考群体(≤100个体)和小测试样本(≤10)的高精度预测,完美适配核心种群规模小、系谱数据有限的现状。全球首次实现单个动物囊胚细胞全基因组千万级SNP分型(准确度94.89%),可预测眼肌面积、背膘厚度等经济性状,将选育周期缩短1-2个世代。相关研究成果以《DPImpute: A Genotype Imputation Framework for Ultra-low Coverage Whole-genome Sequencing and its Application in Genomic Selection》为题,于2025年2月27日在线发表于国际知名期刊(Advanced Science)。
DPImpute是通用型分子育种平台“万相育种加速器”的核心基因型检测模块。该平台在相关研究成果正式发表前即已实现产业化应用,先后荣获广东省首届种业科技创新大比武总决赛十强(2021年)和第二十四届中国国际高新技术成果交易会优秀产品奖(2022年)。平台的成功转化受到《中国科学报》专题报道,并应广东省委宣传部邀请,以“发展农业新质生产力,打造万相育种加速器”为主题作专题报告,并在《广东卫视》广东新闻联播栏目亮相。
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