生物多样性丧失已成为全球生态系统面临的严峻挑战，驱动着保护生物学这一学科通过多维度手段探索物种存续的解决方案。在此框架下，保护遗传学作为保护生物学关键分支，聚焦于解析种群遗传多样性衰减、近交衰退及适应性潜力降低等机制，为制定保护策略提供遗传学依据。基因组学技术的突破性发展正深刻重塑该领域的研究范式：通过全基因组测序获得高分辨率数据可（1）全面解析遗传多样性，精准识别遗传多样性“热点”与“盲区”；（2）深入挖掘物种濒危的遗传根源，精准识别致危的遗传原因；（3）精准绘制濒危物种的遗传结构图谱，划分精细保护单元，制定差异化种群管理；（4）预测种群恢复潜力，为种群复壮提供了全新可能。尽管基因组学极大提升了保护遗传学的精准性，但是未来基因组学技术应与其他技术（如环境DNA、基因编辑技术、古DNA技术、人工智能与大数据）的协同应用将拓展保护遗传学的边界，进一步提升保护策略的维度，促进跨学科融合，推动基因组数据向保护行动转化，为全球生物多样性保护提供技术支撑。